在战斗的最后取回了自己的世界，各自回到自己应在之处的Gatchaman=健、Tekkaman=城二、Polimar=武士、卡辛=铁也四人。 　　但他们为了某个目的，而和笑一同再次跨越时空，降临同一个世界。 　　那里，是威胁和平的人类之敌“恶魔党”大施淫威，与之对抗的Gatchaman率领的“科学忍者队”不停战斗的世界。 　　但，在对于这个世界的样子感到违和感的他们面前，一个男人的身影出现了。那是科学忍者队的创设者南部博士。对本应相识的健露出诡异表情的南部，向英雄们说出了意想不到的话语。“看来你们似乎是我的敌人”……。 　　此外，还有一个一直在楼顶窥视他们的身影。那是曾和健一同并肩对抗恶魔党的，科学忍者队No.2。 　　其名为“神鹰乔”。 　　四大英雄的全新激斗，将在银幕上拉开帷幕！

独自住在涉谷高档住宅区里的高中少女界堂笑虽然过着富裕的生活，但她的父亲借口工作繁忙从不回家，她也因此一直无法相信大人，对未来也没有憧憬。就是在这样一位达观少女的面前，有一天突然出现了4个男人——科学小飞侠、宇宙骑士、破里拳和人造人卡辛。他们都是在自己的世界中各持信念与邪恶战斗的正义英雄。伴随着英雄的降临，谜样的魔手也向界堂笑袭来。为了保护笑，英雄们站了出来。他们的相遇究竟会给界堂笑和这个世界带来什么呢？